Исследования и аналитика в ЛПК Переворот в лесном хозяйстве: ученые из Сибири расшифровали геном сибирской лиственницы
17 февраля 2019 ` 16:00
Для этого ученые Сибирского федерального университета (СФУ) использовали уникальную методику.
Им удалось полностью расшифровали геном сибирской лиственницы, разработав и применив для этого уникальную методику поэтапной сборки генома «по частям». Полученные данные позволят эффективнее культивировать это дерево, имеющее важное экономическое и экологическое значение, сообщила в пятницу пресс-служба Министерства науки и высшего образования РФ.
Методика, которую разработали ученые СФУ для расшифровки генома лиственницы, позволяет осуществлять относительно быструю сборку очень больших геномов на сравнительно небольших объемах вычислительных ресурсов. В ее основе — принцип поэтапной сборки генома «по частям», которая позволяет обойти ограничения современных ассемблеров (сборщиков генов) при вводе большого объема данных. Так, геном лиственницы состоит из 12 млрд нуклеотидных оснований.
Полученные данные, как отмечают ученые, закладывает основу для проведения многих исследований, вплоть до создания базы данных лесных генетических ресурсов для использования в лесном хозяйстве. Например, они позволят контролировать посевной материал для восстановления лесов и использовать те деревья, которые оптимальны для конкретных экологических условий.
«В перспективе — это переход от традиционной селекции к геномной. Такая база данных будет востребована для идентификации происхождения растительного материала в борьбе с нелегальными рубками и нелегальным оборотом древесины. Новые знания о геномах хвойных также являются фундаментом для последующих исследований эволюционных, биохимических и физиологических процессов в этих организмах», — сообщил заведующий лаборатории лесной геномики и НОЦ геномных исследований СФУ Константин Крутовский.
Также в сюжете:
